后，新王继位，对商君态度大变。原来新王做王子之时，便对商君不满，以为此人嚣张跋扈，不是良善之辈。而商君推行新政，得罪了王族贵勋，有人在秦王面前诋毁商君，结果不是被秦王杀死，便是被赶出都城流放。群臣畏惧秦王的威势，不敢再对付商君，只是对商君的仇恨并没有消失，而是藏在心中，终有一日要对商君下手。何况商君处罚的大臣之中，便有秦国王子的师傅在内。待到新王登基，商君知道情形不妙，屡次上书新王，想要辞去官职，回到自己的封地颐养天年，但是新王一概不准，还对他多加安抚和夸赞，要他安心在朝廷做官。
“若是换了别人，以为新王再三挽留自己，对自己不会有什么芥蒂，可以安安心心在秦国做官。可是商君是何等样人，早已看透了新王的心思。他知道新王之所以没有遽然下手对付他，那是因为新王刚刚登基坐殿，内忧外患着实不少，而朝廷中很多大臣都是受商君提拔，自然是商君一伙。若是新王一上台便将商君杀掉，商君的亲信大
臣必定惊恐不安，说不定有人会投奔齐、楚等国。而齐、楚等国畏惧和忌恨秦国，早有侵吞秦国之意，只是因为秦军骁勇善战，各国才不敢动手，而是一直在观望。若是商君的亲信逃到齐、楚等国，他们知晓秦国的虚实，一旦引领各国大军攻打秦国，即便秦军骁勇善战，怎奈双拳难敌四手，最后非得一败涂地不可。是以新王登基之后，才会安抚商君，不许他辞官归隐，以安众臣之心。待到政局平稳之后，再将商君一伙连根拔除，却也不迟！”：，，.